Tuesday, February 8, 2011

Bioinformatics (01416554): Haploview assignment

จากตัวอย่างไฟล์ dumped_region (download from http://cid-a16e4eb55026c7c3.office.live.com/browse.aspx/public?uc=1) ที่ให้ไว้ที่ไฟล์แนบ เป็นไฟล์ในรูปแบบ Hapmap format

ที่สามารถนำไปเปิดดูด้วยโปรแกรม Haploview ได้โดยไม่ต้องทำการแก้ไขไฟล์ใดๆทั้งสิ้น

จงทำการนำเข้าข้อมูลนี้ใช้งานกับโปรแกรม Haploview และตอบคำถามต่อไปนี้

1. จงแสดงค่าสถิติต่างที่ได้จากการนำเข้าข้อมูลที่เตรียมได้ (จากหน้าต่าง check

marker) พร้อมอธิบาย

2. แสดงภาพ linkage disequilibrium map พร้อมอธิบาย

3. แสดงภาพ Haplotype block พร้อมอธิบาย

7 comments:

  1. This comment has been removed by the author.

    ReplyDelete
  2. ส่งการบ้าน ตาม blog ที่อยู่ ลิงค์นี้ค่ะ
    http://popopoy.blogspot.com/2011/02/bioinformatics-01416554-haploview.html

    หรือ กดที่ชื่อ PoY ได้ค่ะ

    ReplyDelete
  3. ขออนุญาติส่งการบ้าน SNP Haploview ตาม link ค่ะ

    1. http://homework-noina.blogspot.com/2011/02/bioinformatic-01416554-haploview.html

    or

    2. http://www.4shared.com/document/UoOXHeSa/SNP.html

    สมาชิกในกลุ่มประกอบด้วย
    นางสาว พชรธร สิมกิ่ง รหัส 5229000082
    นางสาวธัญญาพร สุสานนท์ รหัส 5229000147
    นางสาวศุภิสรา โคตรโสภา รหัส 5226000081
    นางสาวเกศินี กำพุฒ รหัส 5214402317
    นางสาวขนิษฐา แสงสว่าง รหัส 5214402848

    ด้วยความเคราพ
    นางสาวศุภิสรา โคตรโสภา

    ReplyDelete
  4. กราบเรียนอาจารย์วสันต์

    ขออนุญาตส่งการบ้านวิชา Bioinformatics ในหัวเรื่อง SNPs and HapMap datadase
    ในสังกัดภาควิชาพันธุศาสตร์ มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
    และกราบขออภัยที่ส่งงานมาช้า


    ด้วยความเคารพอย่างยิ่ง

    วิศรุต ชัยเลิศฤทธิ์

    PDF file
    http://www.pirun.ku.ac.th/~g5314900173/Haploview/SNP%20home%20work.pdf

    blog
    http://popopoy.blogspot.com/2011/02/bioinformatics-snps-and-hapmap-database.html

    ReplyDelete
  5. การบ้าน Bioinformatics (01416554)
    Haploview assignment

    เสนอ
    ร.ศ. ดร. วสันต์ จันทราทิตย์

    จัดทำโดย
    นางสาวหทัยรัตน์ ราชนิยม 5217400412
    นายปาณัสม์ พูลสวัสดิ์ 5314400995
    นายอภิศักดิ์ หลักฐาน 5314401100
    นางสาวอรสิริ ศิริพันธุ์ 5314401118
    นายวรรัตน์ เครือสุวรรณ์ 5317400201

    PDF file
    http://www.pirun.ku.ac.th/~g5314900173/Haploview/Haploview%20assignment.pdf

    Blog
    http://popopoy.blogspot.com/2011/03/bioinformatics-01416554-haploview.html

    ReplyDelete
  6. ขออณุญาต ส่งการบ้านวิชา Bioinformatics

    เรื่อง
    Haploview assignment

    เสนอ
    ร.ศ. ดร. วสันต์ จันทราทิตย์

    สมาชิกในกลุ่ม
    นางสาวนลิน พุ่มทองดี 5314401631
    นางสาวพิรพรรณ พลบุรี 5317400228
    นางสาวชุตินันท์ คงจรินทร์ 5314401614
    นางสาววัชรา จันทาสี 531440448
    นางสาวปัจพร อนุรัตน์ 5314401649
    นางสาวภัทรกันย์ มีศิริ 5314400391

    blog
    http://5317400228.blogspot.com/

    ด้วยความเคารพ
    นางสาวพิรพรรณ พลบุรี

    ReplyDelete
  7. PDF
    http://www.pirun.ku.ac.th/~g5314900173/Haploview/homework_Haploview.pdf

    blog
    http://popopoy.blogspot.com/2011/03/homeworkhaploview.html

    รายชื่อสมาชิกในกลุ่ม
    1. นางสาวธันย์ณิชา ชำนาญป่า 5214402660
    2. นางสาวสโรชา ชูช่วย 5214400705
    3. นายกีรติชัยนันต์ จรรยาเพศ 5314400286
    4. นางสาวสุภาวดี มนัสวีระพร 5314400472
    5. นางสาววีราวัลย์ ปรีชาสิทธิคุณ 5214402686
    6. นางสาวสิรินัดดา ร่วมพร 5214402708

    ReplyDelete